MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid C

Total Repeats: 5333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007412	AGC	2	6	281998	282003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812891
5002	NC_007412	ATT	2	6	282010	282015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812891
5003	NC_007412	ATTG	2	8	282054	282061	25 %	50 %	25 %	0 %	75812891
5004	NC_007412	TAG	2	6	282182	282187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812891
5005	NC_007412	TTTC	2	8	282281	282288	0 %	75 %	0 %	25 %	75812891
5006	NC_007412	TTC	2	6	282291	282296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812891
5007	NC_007412	TGA	2	6	282347	282352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812891
5008	NC_007412	ATC	2	6	282504	282509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812891
5009	NC_007412	GCA	2	6	282536	282541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812891
5010	NC_007412	AGT	2	6	282588	282593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812892
5011	NC_007412	TCC	2	6	282594	282599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812892
5012	NC_007412	TCT	2	6	282615	282620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812892
5013	NC_007412	TTC	2	6	282686	282691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812892
5014	NC_007412	TTG	2	6	282702	282707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812892
5015	NC_007412	TAT	2	6	282715	282720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812892
5016	NC_007412	AAT	2	6	282728	282733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812892
5017	NC_007412	GCA	3	9	282762	282770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812892
5018	NC_007412	TTG	3	9	282809	282817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812892
5019	NC_007412	TAA	2	6	282943	282948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812892
5020	NC_007412	CAT	2	6	283024	283029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812892
5021	NC_007412	GAA	2	6	283078	283083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812892
5022	NC_007412	TAA	2	6	283171	283176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812892
5023	NC_007412	T	7	7	283178	283184	0 %	100 %	0 %	0 %	75812892
5024	NC_007412	AG	3	6	283185	283190	50 %	0 %	50 %	0 %	75812892
5025	NC_007412	TAA	2	6	283225	283230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812892
5026	NC_007412	AGA	2	6	283239	283244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812892
5027	NC_007412	TCAG	2	8	283272	283279	25 %	25 %	25 %	25 %	75812892
5028	NC_007412	AAT	2	6	283290	283295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812892
5029	NC_007412	A	6	6	283311	283316	100 %	0 %	0 %	0 %	75812892
5030	NC_007412	T	6	6	283344	283349	0 %	100 %	0 %	0 %	75812892
5031	NC_007412	TCC	2	6	283386	283391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812892
5032	NC_007412	ACA	2	6	283435	283440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812892
5033	NC_007412	AT	3	6	283599	283604	50 %	50 %	0 %	0 %	75812892
5034	NC_007412	TC	3	6	283638	283643	0 %	50 %	0 %	50 %	75812892
5035	NC_007412	GTC	2	6	283687	283692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812892
5036	NC_007412	ATTT	2	8	283699	283706	25 %	75 %	0 %	0 %	75812892
5037	NC_007412	TA	3	6	283723	283728	50 %	50 %	0 %	0 %	75812892
5038	NC_007412	CAA	2	6	283797	283802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812892
5039	NC_007412	GAAA	2	8	283858	283865	75 %	0 %	25 %	0 %	75812892
5040	NC_007412	CTTC	2	8	283983	283990	0 %	50 %	0 %	50 %	75812892
5041	NC_007412	CTT	2	6	284065	284070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812892
5042	NC_007412	TG	3	6	284097	284102	0 %	50 %	50 %	0 %	75812892
5043	NC_007412	GAG	2	6	284131	284136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812892
5044	NC_007412	TGA	2	6	284148	284153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812892
5045	NC_007412	ATTG	2	8	284155	284162	25 %	50 %	25 %	0 %	75812892
5046	NC_007412	GCT	2	6	284163	284168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812892
5047	NC_007412	TAA	2	6	284197	284202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812892
5048	NC_007412	TAAA	2	8	284324	284331	75 %	25 %	0 %	0 %	75812892
5049	NC_007412	TTC	2	6	284339	284344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812892
5050	NC_007412	CAT	2	6	284359	284364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812892
5051	NC_007412	TAA	2	6	284408	284413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812892
5052	NC_007412	GTA	2	6	284415	284420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812892
5053	NC_007412	TCA	2	6	284466	284471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812892
5054	NC_007412	ATT	2	6	284495	284500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812892
5055	NC_007412	CTT	2	6	284506	284511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812892
5056	NC_007412	TCG	2	6	284513	284518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812892
5057	NC_007412	AAT	2	6	284572	284577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812892
5058	NC_007412	GTT	2	6	284608	284613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812892
5059	NC_007412	GTT	2	6	284623	284628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812892
5060	NC_007412	TAA	2	6	284656	284661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812892
5061	NC_007412	A	8	8	284710	284717	100 %	0 %	0 %	0 %	75812892
5062	NC_007412	GTCCAA	2	12	284746	284757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812892
5063	NC_007412	TCA	2	6	284826	284831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812892
5064	NC_007412	CAT	2	6	284842	284847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812892
5065	NC_007412	TAA	2	6	284848	284853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812892
5066	NC_007412	A	6	6	284852	284857	100 %	0 %	0 %	0 %	75812892
5067	NC_007412	GCA	2	6	284872	284877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812892
5068	NC_007412	CCA	2	6	284934	284939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812892
5069	NC_007412	TGA	2	6	284965	284970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812892
5070	NC_007412	TTGT	2	8	284981	284988	0 %	75 %	25 %	0 %	75812892
5071	NC_007412	GCT	2	6	285021	285026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812892
5072	NC_007412	A	6	6	285036	285041	100 %	0 %	0 %	0 %	75812892
5073	NC_007412	CT	3	6	285062	285067	0 %	50 %	0 %	50 %	75812892
5074	NC_007412	TCT	2	6	285542	285547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812893
5075	NC_007412	AT	3	6	285567	285572	50 %	50 %	0 %	0 %	75812893
5076	NC_007412	GCT	2	6	285594	285599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812893
5077	NC_007412	ACA	2	6	285650	285655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812893
5078	NC_007412	TGT	2	6	285693	285698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812893
5079	NC_007412	AT	3	6	285719	285724	50 %	50 %	0 %	0 %	75812893
5080	NC_007412	CTC	2	6	285760	285765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812893
5081	NC_007412	TAAATA	2	12	285807	285818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812893
5082	NC_007412	ATA	2	6	285829	285834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812893
5083	NC_007412	T	6	6	285977	285982	0 %	100 %	0 %	0 %	75812893
5084	NC_007412	ATT	2	6	285991	285996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812893
5085	NC_007412	TTA	2	6	286052	286057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812893
5086	NC_007412	ACT	2	6	286067	286072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812893
5087	NC_007412	TGGC	2	8	286091	286098	0 %	25 %	50 %	25 %	75812893
5088	NC_007412	ACT	2	6	286135	286140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812893
5089	NC_007412	CGG	2	6	286204	286209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812893
5090	NC_007412	CGA	3	9	286298	286306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812893
5091	NC_007412	TTC	2	6	286316	286321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812893
5092	NC_007412	CTG	2	6	286365	286370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812893
5093	NC_007412	ATC	2	6	286397	286402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812893
5094	NC_007412	CCCAGA	2	12	286426	286437	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75812893
5095	NC_007412	AAAG	2	8	286505	286512	75 %	0 %	25 %	0 %	75812893
5096	NC_007412	TCA	2	6	286520	286525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812893
5097	NC_007412	ATAA	2	8	286548	286555	75 %	25 %	0 %	0 %	75812893
5098	NC_007412	AAT	2	6	286639	286644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812893
5099	NC_007412	TCT	2	6	286778	286783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812893
5100	NC_007412	AGT	2	6	286818	286823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812893
5101	NC_007412	T	7	7	286852	286858	0 %	100 %	0 %	0 %	75812893
5102	NC_007412	AT	3	6	286898	286903	50 %	50 %	0 %	0 %	75812893
5103	NC_007412	AAGA	2	8	286934	286941	75 %	0 %	25 %	0 %	75812893
5104	NC_007412	A	6	6	287000	287005	100 %	0 %	0 %	0 %	75812893
5105	NC_007412	TGA	2	6	287085	287090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812893
5106	NC_007412	GTA	2	6	287189	287194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812893
5107	NC_007412	CAA	2	6	287223	287228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812893
5108	NC_007412	AAT	2	6	287245	287250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812893
5109	NC_007412	TCA	2	6	287351	287356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812893
5110	NC_007412	AT	3	6	287367	287372	50 %	50 %	0 %	0 %	75812893
5111	NC_007412	GA	3	6	287385	287390	50 %	0 %	50 %	0 %	75812893
5112	NC_007412	TTC	2	6	287393	287398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812893
5113	NC_007412	TCT	2	6	287451	287456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812893
5114	NC_007412	T	7	7	287490	287496	0 %	100 %	0 %	0 %	75812893
5115	NC_007412	TTG	2	6	287514	287519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812893
5116	NC_007412	TAT	2	6	287526	287531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812893
5117	NC_007412	CGC	2	6	287660	287665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812893
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5119	NC_007412	AAT	2	6	287770	287775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812893
5120	NC_007412	TGC	2	6	287821	287826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812893
5121	NC_007412	T	6	6	287891	287896	0 %	100 %	0 %	0 %	75812893
5122	NC_007412	AGA	2	6	287910	287915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812893
5123	NC_007412	TCG	2	6	287927	287932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812893
5124	NC_007412	GGC	2	6	288098	288103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812893
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.